总长287公里的杭黄铁路，绝大部分线路位于浙江境内，安徽境内长度约81公里。从杭州东站始发，依次经过萧山、富阳、桐庐、建德东、淳安、三阳、绩溪北、歙县北，终点站为黄山北。黄山北站距黄山风景区约50公里，坐汽车半个小时就能到，同时杭黄铁路通车后，杭州到黄山最快只要一个半小时。而且通过与沪杭、杭甬、杭宁高铁相连，上海、宁波、南京等地到黄山，也只要2个多小时。

杭黄铁路正线长265.244公里，变更环评后，总里程变化不大。不过，在原规划基础上新增了歙县北、三阳两个停靠站。全线车站数量增加到10个。除杭州东外，富阳、桐庐、建德东、淳安、三阳、绩溪北、歙县北、黄山北等9个车站，都是新建车站;萧山(杭州南)站将改扩建。